环境署致力于保护、养护和恢复世界上的湖泊、河流和地下蓄水层，它们正承受着三重地球危机带来的不断增加的压力。 

环境署与联合国水机制 (UN Water) 社区共同发起了联合国全系统水与卫生战略。环境署和联合国水机制共同编制了《可持续发展目标6指标中期状况报告》，为决策者提出了建议。报告发现，全世界半数国家的淡水生态系统正在退化，402个流域的河流流动正在减缓，其中包括刚果河、巴拉那河和伏尔加河流域。 

环境署扩大了国家层面的工作，支持巴西和印度流域的可持续管理以及刚果盆地泥炭地的保护。环境署还推进了与国际扶轮社的伙伴关系，旨在为扶轮社140万名成员成为公民科学家提供培训，并追踪淡水水体的健康状况。 

环境署与多个合作伙伴共同发起了“关于水促进气候行动的巴库对话”——这是一系列旨在提升水之于气候行动作用的国家间讨论。