يقع مقر أمانة البرنامج الخاص في جنيف، سويسرا.
تقدم أمانة البرنامج الخاص الدعم الإداري للبرنامج الخاص. كما تسهل عمل المجلس التنفيذي وتدير الدعوات إلى تقديم طلبات التمويل فضلاً عن توفير الإشراف على المشاريع المعتمدة وتقديم التقارير. قائمة المشاريع والموظفين المكلفين.
كاثرين ثيوتوكاتوس، مواطنة من جنوب أفريقيا، تعمل كمنسقة أمانة البرنامج الخاص. وهي توجه عمل أمانة البرنامج الخاص وتقوم بدور قيادي في العلاقات مع الجهات المانحة وتعبئة الموارد وإعداد التقارير.
فيليكس هيرزوغ، مواطن إسباني وسويسري، يعمل كأخصائي الرصد والتقييم في أمانة البرنامج الخاص. وهو يوجه عمل البرنامج الخاص فيما يتعلق بالرصد والتقييم وتسجيل نتائج مشاريع البرنامج الخاص.
إدواردو كالديرا بيتيت، مواطن فنزويلي، يعمل كمسؤول إدارة البرنامج في أمانة البرنامج الخاص، حيث يقدم المساعدة الفنية للدول التي تعمل على تعزيز إدارة المواد الكيميائية والنفايات وتقييم مقترحات التمويل. كما يقود استراتيجية الاتصالات الخاصة بالبرنامج الخاص، مما يضمن اتباع نهج متسق وفعال للاتصال ونشر المعلومات.
نيكول سيزار، مواطنة من بربادوس وسانت لوسيا، تعمل كمسؤولة مساعدة للبرنامج حيث تقدم المساعدة الفنية والدعم التشغيلي للأمانة العامة. ويركز دورها على إدارة المشاريع وإدارة البرامج وتطوير وتنفيذ استراتيجية إشراك القطاع الخاص في البرنامج الخاص.
باسكال أونجر، مواطنة فرنسية، تعمل كمساعدة إدارية لأمانة البرنامج الخاص.
أولكسندر نازارينكو، مواطن من أوكرانيا، يشغل منصب مساعد المالية والميزانية لأمانة البرنامج الخاص. ويدعم أليكس جوانب المحاسبة وتكنولوجيا المعلومات وإعداد التقارير لأنشطة الفريق.
إيزابيلا مارشي، مواطنة إيطالية وبرازيلية، تعمل كمساعدة للفريق في أمانة البرنامج الخاص. تدعم إيزابيلا الفريق في إدارة البيانات وتساهم في تنفيذ استراتيجية الاتصال الخاصة بالبرنامج الخاص.